Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r29Q9EQ41 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r29Q9EQ41 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r29Q9EQ41 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r29Q9EQ41 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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