Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aph1cQ9DCZ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aph1cQ9DCZ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aph1cQ9DCZ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms