Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp27a1Q9DBG1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp27a1Q9DBG1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp27a1Q9DBG1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp27a1Q9DBG1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp27a1Q9DBG1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp27a1Q9DBG1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp27a1Q9DBG1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cyp27a1Q9DBG1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cyp27a1Q9DBG1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms