Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU9

Znf654, Zinc finger protein 654, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf654Q9DAU9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf654Q9DAU9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf654Q9DAU9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf654Q9DAU9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf654Q9DAU9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf654Q9DAU9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf654Q9DAU9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf654Q9DAU9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf654Q9DAU9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf654Q9DAU9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf654Q9DAU9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf654Q9DAU9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf654Q9DAU9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf654Q9DAU9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf654Q9DAU9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf654Q9DAU9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms