Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Bpifa3Q9D9J8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bpifa3Q9D9J8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bpifa3Q9D9J8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bpifa3Q9D9J8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bpifa3Q9D9J8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bpifa3Q9D9J8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms