Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y0

Efhd2, EF-hand domain-containing protein D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd2Q9D8Y0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efhd2Q9D8Y0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efhd2Q9D8Y0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efhd2Q9D8Y0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efhd2Q9D8Y0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efhd2Q9D8Y0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efhd2Q9D8Y0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efhd2Q9D8Y0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efhd2Q9D8Y0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efhd2Q9D8Y0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efhd2Q9D8Y0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efhd2Q9D8Y0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd2Q9D8Y0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhd2Q9D8Y0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms