Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc9bQ9D6E4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc9bQ9D6E4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc9bQ9D6E4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc9bQ9D6E4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc9bQ9D6E4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc9bQ9D6E4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc9bQ9D6E4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc9bQ9D6E4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc9bQ9D6E4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ttc9bQ9D6E4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc9bQ9D6E4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms