Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clvs1Q9D4C9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clvs1Q9D4C9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clvs1Q9D4C9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clvs1Q9D4C9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms