Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Clvs1Q9D4C9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Clvs1Q9D4C9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Clvs1Q9D4C9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Clvs1Q9D4C9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Clvs1Q9D4C9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clvs1Q9D4C9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clvs1Q9D4C9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clvs1Q9D4C9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clvs1Q9D4C9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clvs1Q9D4C9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clvs1Q9D4C9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clvs1Q9D4C9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Clvs1Q9D4C9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clvs1Q9D4C9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clvs1Q9D4C9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Clvs1Q9D4C9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clvs1Q9D4C9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clvs1Q9D4C9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clvs1Q9D4C9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clvs1Q9D4C9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clvs1Q9D4C9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Clvs1Q9D4C9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clvs1Q9D4C9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Clvs1Q9D4C9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Clvs1Q9D4C9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clvs1Q9D4C9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clvs1Q9D4C9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clvs1Q9D4C9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clvs1Q9D4C9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clvs1Q9D4C9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clvs1Q9D4C9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clvs1Q9D4C9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clvs1Q9D4C9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clvs1Q9D4C9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clvs1Q9D4C9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Clvs1Q9D4C9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clvs1Q9D4C9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clvs1Q9D4C9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clvs1Q9D4C9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clvs1Q9D4C9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clvs1Q9D4C9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clvs1Q9D4C9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Clvs1Q9D4C9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clvs1Q9D4C9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clvs1Q9D4C9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clvs1Q9D4C9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clvs1Q9D4C9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Clvs1Q9D4C9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clvs1Q9D4C9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clvs1Q9D4C9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clvs1Q9D4C9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clvs1Q9D4C9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clvs1Q9D4C9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clvs1Q9D4C9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clvs1Q9D4C9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clvs1Q9D4C9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clvs1Q9D4C9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clvs1Q9D4C9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clvs1Q9D4C9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clvs1Q9D4C9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clvs1Q9D4C9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clvs1Q9D4C9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Clvs1Q9D4C9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clvs1Q9D4C9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clvs1Q9D4C9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clvs1Q9D4C9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clvs1Q9D4C9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Clvs1Q9D4C9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clvs1Q9D4C9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clvs1Q9D4C9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clvs1Q9D4C9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clvs1Q9D4C9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clvs1Q9D4C9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clvs1Q9D4C9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clvs1Q9D4C9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clvs1Q9D4C9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Clvs1Q9D4C9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clvs1Q9D4C9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clvs1Q9D4C9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clvs1Q9D4C9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clvs1Q9D4C9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clvs1Q9D4C9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clvs1Q9D4C9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clvs1Q9D4C9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clvs1Q9D4C9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clvs1Q9D4C9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clvs1Q9D4C9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clvs1Q9D4C9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clvs1Q9D4C9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clvs1Q9D4C9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clvs1Q9D4C9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clvs1Q9D4C9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clvs1Q9D4C9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Clvs1Q9D4C9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clvs1Q9D4C9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clvs1Q9D4C9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms