Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Katnal2Q9D3R6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Katnal2Q9D3R6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Katnal2Q9D3R6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms