Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc8Q9D2H8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc8Q9D2H8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc8Q9D2H8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc8Q9D2H8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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