Protein–RNA interactions for Protein: Q9D279

Misp, Mitotic interactor and substrate of PLK1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MispQ9D279 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MispQ9D279 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MispQ9D279 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MispQ9D279 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MispQ9D279 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MispQ9D279 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MispQ9D279 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MispQ9D279 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MispQ9D279 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MispQ9D279 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MispQ9D279 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MispQ9D279 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MispQ9D279 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MispQ9D279 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MispQ9D279 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MispQ9D279 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MispQ9D279 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MispQ9D279 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MispQ9D279 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MispQ9D279 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MispQ9D279 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MispQ9D279 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MispQ9D279 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MispQ9D279 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MispQ9D279 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MispQ9D279 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MispQ9D279 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MispQ9D279 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MispQ9D279 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MispQ9D279 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MispQ9D279 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MispQ9D279 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MispQ9D279 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MispQ9D279 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MispQ9D279 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MispQ9D279 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MispQ9D279 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MispQ9D279 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MispQ9D279 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms