Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prkrip1Q9CWV6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prkrip1Q9CWV6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prkrip1Q9CWV6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prkrip1Q9CWV6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Prkrip1Q9CWV6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prkrip1Q9CWV6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prkrip1Q9CWV6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prkrip1Q9CWV6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Prkrip1Q9CWV6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prkrip1Q9CWV6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prkrip1Q9CWV6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms