Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nicn1Q9CQM0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nicn1Q9CQM0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Nicn1Q9CQM0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nicn1Q9CQM0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nicn1Q9CQM0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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