Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nipsnap3bQ9CQE1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nipsnap3bQ9CQE1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nipsnap3bQ9CQE1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1199.1 ms