Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr3Q99MB1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tlr3Q99MB1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlr3Q99MB1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr3Q99MB1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr3Q99MB1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms