Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rwdd2bQ99M03 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd2bQ99M03 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rwdd2bQ99M03 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rwdd2bQ99M03 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms