Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nrbp1Q99J45 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Nrbp1Q99J45 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Nrbp1Q99J45 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nrbp1Q99J45 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nrbp1Q99J45 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nrbp1Q99J45 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nrbp1Q99J45 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nrbp1Q99J45 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms