Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smim11aQ99J19 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smim11aQ99J19 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smim11aQ99J19 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smim11aQ99J19 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smim11aQ99J19 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms