Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sntg1Q925E1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sntg1Q925E1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms