Protein–RNA interactions for Protein: Q924N4

Slc12a6, Solute carrier family 12 member 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a6Q924N4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc12a6Q924N4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc12a6Q924N4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc12a6Q924N4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc12a6Q924N4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc12a6Q924N4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms