Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Alpk3Q924C5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Alpk3Q924C5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Alpk3Q924C5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Alpk3Q924C5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Alpk3Q924C5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Alpk3Q924C5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Alpk3Q924C5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Alpk3Q924C5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Alpk3Q924C5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Alpk3Q924C5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Alpk3Q924C5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Alpk3Q924C5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Alpk3Q924C5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Alpk3Q924C5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Alpk3Q924C5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Alpk3Q924C5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Alpk3Q924C5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Alpk3Q924C5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Alpk3Q924C5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Alpk3Q924C5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Alpk3Q924C5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Alpk3Q924C5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Alpk3Q924C5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Alpk3Q924C5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Alpk3Q924C5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Alpk3Q924C5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Alpk3Q924C5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Alpk3Q924C5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Alpk3Q924C5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Alpk3Q924C5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Alpk3Q924C5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Alpk3Q924C5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Alpk3Q924C5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Alpk3Q924C5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Alpk3Q924C5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Alpk3Q924C5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Alpk3Q924C5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Alpk3Q924C5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Alpk3Q924C5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Alpk3Q924C5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Alpk3Q924C5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Alpk3Q924C5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Alpk3Q924C5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Alpk3Q924C5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Alpk3Q924C5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Alpk3Q924C5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Alpk3Q924C5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Alpk3Q924C5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Alpk3Q924C5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Alpk3Q924C5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Alpk3Q924C5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Alpk3Q924C5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms