Protein–RNA interactions for Protein: Q922M5

Cdca7l, Cell division cycle-associated 7-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7lQ922M5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdca7lQ922M5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdca7lQ922M5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdca7lQ922M5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdca7lQ922M5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cdca7lQ922M5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdca7lQ922M5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdca7lQ922M5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdca7lQ922M5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdca7lQ922M5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdca7lQ922M5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdca7lQ922M5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdca7lQ922M5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdca7lQ922M5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdca7lQ922M5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdca7lQ922M5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdca7lQ922M5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdca7lQ922M5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdca7lQ922M5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdca7lQ922M5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdca7lQ922M5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdca7lQ922M5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdca7lQ922M5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cdca7lQ922M5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdca7lQ922M5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdca7lQ922M5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms