Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmco4Q91WU4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmco4Q91WU4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmco4Q91WU4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmco4Q91WU4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmco4Q91WU4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmco4Q91WU4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmco4Q91WU4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmco4Q91WU4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmco4Q91WU4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmco4Q91WU4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmco4Q91WU4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmco4Q91WU4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmco4Q91WU4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmco4Q91WU4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmco4Q91WU4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco4Q91WU4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms