Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn8Q91VA3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn8Q91VA3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn8Q91VA3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Capn8Q91VA3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn8Q91VA3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms