Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Cul7Q8VE73 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cul7Q8VE73 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Cul7Q8VE73 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cul7Q8VE73 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cul7Q8VE73 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cul7Q8VE73 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cul7Q8VE73 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cul7Q8VE73 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Cul7Q8VE73 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cul7Q8VE73 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cul7Q8VE73 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cul7Q8VE73 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cul7Q8VE73 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cul7Q8VE73 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cul7Q8VE73 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cul7Q8VE73 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cul7Q8VE73 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Cul7Q8VE73 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cul7Q8VE73 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cul7Q8VE73 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cul7Q8VE73 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cul7Q8VE73 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cul7Q8VE73 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cul7Q8VE73 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cul7Q8VE73 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cul7Q8VE73 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cul7Q8VE73 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cul7Q8VE73 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cul7Q8VE73 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cul7Q8VE73 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cul7Q8VE73 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cul7Q8VE73 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cul7Q8VE73 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Cul7Q8VE73 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cul7Q8VE73 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cul7Q8VE73 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cul7Q8VE73 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cul7Q8VE73 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cul7Q8VE73 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Cul7Q8VE73 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cul7Q8VE73 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cul7Q8VE73 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cul7Q8VE73 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cul7Q8VE73 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cul7Q8VE73 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cul7Q8VE73 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms