Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm4cQ8VCD7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Kdm4cQ8VCD7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kdm4cQ8VCD7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm4cQ8VCD7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm4cQ8VCD7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm4cQ8VCD7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms