Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc58Q8R3Q6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc58Q8R3Q6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc58Q8R3Q6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms