Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colec12Q8K4Q8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colec12Q8K4Q8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colec12Q8K4Q8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colec12Q8K4Q8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms