Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sash3Q8K352 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sash3Q8K352 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sash3Q8K352 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sash3Q8K352 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sash3Q8K352 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sash3Q8K352 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sash3Q8K352 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms