Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T4

Uqcc3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uqcc3Q8K2T4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uqcc3Q8K2T4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uqcc3Q8K2T4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Uqcc3Q8K2T4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Uqcc3Q8K2T4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uqcc3Q8K2T4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uqcc3Q8K2T4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uqcc3Q8K2T4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms