Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LgsnQ8CIX8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LgsnQ8CIX8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LgsnQ8CIX8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LgsnQ8CIX8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LgsnQ8CIX8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LgsnQ8CIX8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LgsnQ8CIX8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LgsnQ8CIX8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LgsnQ8CIX8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LgsnQ8CIX8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LgsnQ8CIX8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LgsnQ8CIX8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LgsnQ8CIX8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LgsnQ8CIX8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LgsnQ8CIX8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LgsnQ8CIX8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms