Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mterf1aQ8CHZ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mterf1aQ8CHZ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mterf1aQ8CHZ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms