Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
6030452D12RikQ8CD33 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
6030452D12RikQ8CD33 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6030452D12RikQ8CD33 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
6030452D12RikQ8CD33 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6030452D12RikQ8CD33 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
6030452D12RikQ8CD33 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6030452D12RikQ8CD33 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6030452D12RikQ8CD33 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6030452D12RikQ8CD33 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6030452D12RikQ8CD33 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6030452D12RikQ8CD33 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
6030452D12RikQ8CD33 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6030452D12RikQ8CD33 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6030452D12RikQ8CD33 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms