Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tsr2Q8C8T8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tsr2Q8C8T8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tsr2Q8C8T8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tsr2Q8C8T8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tsr2Q8C8T8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tsr2Q8C8T8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tsr2Q8C8T8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tsr2Q8C8T8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tsr2Q8C8T8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tsr2Q8C8T8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tsr2Q8C8T8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms