Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc90bQ8C3X2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc90bQ8C3X2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc90bQ8C3X2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc90bQ8C3X2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc90bQ8C3X2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms