Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccser1Q8C0C4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccser1Q8C0C4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccser1Q8C0C4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccser1Q8C0C4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccser1Q8C0C4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccser1Q8C0C4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccser1Q8C0C4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccser1Q8C0C4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccser1Q8C0C4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccser1Q8C0C4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccser1Q8C0C4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccser1Q8C0C4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccser1Q8C0C4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccser1Q8C0C4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccser1Q8C0C4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccser1Q8C0C4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccser1Q8C0C4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccser1Q8C0C4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccser1Q8C0C4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccser1Q8C0C4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccser1Q8C0C4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccser1Q8C0C4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccser1Q8C0C4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccser1Q8C0C4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccser1Q8C0C4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccser1Q8C0C4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
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