Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbbp5Q8BX09 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbbp5Q8BX09 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp5Q8BX09 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp5Q8BX09 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbbp5Q8BX09 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp5Q8BX09 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms