Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm4aQ8BW72 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm4aQ8BW72 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm4aQ8BW72 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm4aQ8BW72 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm4aQ8BW72 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm4aQ8BW72 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kdm4aQ8BW72 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms