Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cc2d1bQ8BRN9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cc2d1bQ8BRN9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cc2d1bQ8BRN9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cc2d1bQ8BRN9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cc2d1bQ8BRN9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cc2d1bQ8BRN9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cc2d1bQ8BRN9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cc2d1bQ8BRN9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cc2d1bQ8BRN9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cc2d1bQ8BRN9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cc2d1bQ8BRN9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cc2d1bQ8BRN9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cc2d1bQ8BRN9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cc2d1bQ8BRN9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cc2d1bQ8BRN9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cc2d1bQ8BRN9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cc2d1bQ8BRN9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cc2d1bQ8BRN9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cc2d1bQ8BRN9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cc2d1bQ8BRN9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cc2d1bQ8BRN9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cc2d1bQ8BRN9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms