Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spock3Q8BKV0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock3Q8BKV0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spock3Q8BKV0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spock3Q8BKV0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms