Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJZ4

Mrps35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps35Q8BJZ4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrps35Q8BJZ4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrps35Q8BJZ4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrps35Q8BJZ4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrps35Q8BJZ4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrps35Q8BJZ4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrps35Q8BJZ4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrps35Q8BJZ4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrps35Q8BJZ4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps35Q8BJZ4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps35Q8BJZ4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps35Q8BJZ4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps35Q8BJZ4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps35Q8BJZ4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps35Q8BJZ4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps35Q8BJZ4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms