Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AW551984Q8BGF0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AW551984Q8BGF0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AW551984Q8BGF0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AW551984Q8BGF0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AW551984Q8BGF0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AW551984Q8BGF0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AW551984Q8BGF0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AW551984Q8BGF0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AW551984Q8BGF0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AW551984Q8BGF0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AW551984Q8BGF0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AW551984Q8BGF0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AW551984Q8BGF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AW551984Q8BGF0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AW551984Q8BGF0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms