Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Liat1Q810M6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Liat1Q810M6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Liat1Q810M6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Liat1Q810M6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Liat1Q810M6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Liat1Q810M6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Liat1Q810M6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Liat1Q810M6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Liat1Q810M6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Liat1Q810M6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Liat1Q810M6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Liat1Q810M6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Liat1Q810M6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Liat1Q810M6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Liat1Q810M6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Liat1Q810M6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Liat1Q810M6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Liat1Q810M6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Liat1Q810M6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms