Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR1

Tspan18, Tetraspanin-18, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan18Q80WR1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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Tspan18Q80WR1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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Tspan18Q80WR1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
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Tspan18Q80WR1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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Tspan18Q80WR1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan18Q80WR1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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Tspan18Q80WR1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan18Q80WR1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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