Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pnma8aQ80VM8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pnma8aQ80VM8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pnma8aQ80VM8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pnma8aQ80VM8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pnma8aQ80VM8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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