Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc93Q7TQK5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc93Q7TQK5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc93Q7TQK5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc93Q7TQK5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc93Q7TQK5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms