Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ07

Poln, DNA polymerase nu, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolnQ7TQ07 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolnQ7TQ07 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolnQ7TQ07 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolnQ7TQ07 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolnQ7TQ07 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolnQ7TQ07 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolnQ7TQ07 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolnQ7TQ07 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolnQ7TQ07 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolnQ7TQ07 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolnQ7TQ07 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolnQ7TQ07 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PolnQ7TQ07 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolnQ7TQ07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolnQ7TQ07 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PolnQ7TQ07 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolnQ7TQ07 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolnQ7TQ07 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolnQ7TQ07 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PolnQ7TQ07 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms