Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Actn1Q7TPR4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Actn1Q7TPR4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Actn1Q7TPR4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Actn1Q7TPR4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Actn1Q7TPR4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Actn1Q7TPR4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Actn1Q7TPR4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Actn1Q7TPR4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Actn1Q7TPR4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Actn1Q7TPR4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Actn1Q7TPR4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Actn1Q7TPR4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Actn1Q7TPR4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Actn1Q7TPR4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Actn1Q7TPR4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Actn1Q7TPR4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Actn1Q7TPR4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms