Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zfp397Q7TNK4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp397Q7TNK4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp397Q7TNK4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp397Q7TNK4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.5 ms